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医疗纠纷的司法鉴定，属于临床医学鉴定的范畴。虽然医疗纠纷鉴定与医疗事故和人身伤害司法鉴定在鉴定内容、鉴定人等方面都有交叉，但是，仍存在较大差别。
国务院《医疗事故处理条例》颁布后，规定了医疗事故处理的三种途径：一是当事人申请医疗事故的技术鉴定，二是请求行政调解，三是通过诉讼由司法裁决解决。因此，在医学会的医疗事故鉴定后，并不排斥对医疗事故或纠纷的司法鉴定。法官完全可以委托司法鉴定机构对争议事实进行司法鉴定，只是不解决是否属于医疗事故的问题，不作医疗事故的定性鉴定。法院委托的医疗纠纷司法鉴定，主要是伤残程度、因果关系和死因判断。第二，从技术层面看，各地相继成立的社会司法鉴定机构能够承担鉴定任务，特别是司法鉴定委员会具有技术优势，专家委也能够承担一般鉴定机构无法承担的鉴定任务。目前医疗事故与纠纷的鉴定弊端很多，鉴定周期长，鉴定结论公信度差，无论从加强管理还是解决鉴定中的实际问题，如降低司法鉴定成本、提高司法效率考虑，均需要专家委员会承担医疗纠纷的司法鉴定工作。
司法鉴定机构在有条件、能力的基础上，受理医疗纠纷的初次司法鉴定，以方便当事人，方便诉讼；而司法鉴定委员会主要受理医疗纠纷司法鉴定的复核鉴定。建立鉴定的公正程序，如试行医疗纠纷鉴定的听证程序模式，在正式鉴定前患者或家属、医院等先通过听证程序解决鉴定材料的真实性问题，全面了解案情，仔细听取双方对鉴定的要求和主张，使鉴定尽可能地做到客观、公正。
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